Archivo de la categoría: estrategias computacionales

dianas 15 (1) A.-Bárcenas etal 2026 Generación de modelos anatómicos 3D a partir de imágenes 2D de atlas anatómicos o texto con IA.

dianas 15(1) > A.-Bárcenas etal

dianas | Vol 15 Num 1 | marzo 2026 | e202603x028

Generación de modelos anatómicos 3D a partir de imágenes 2D de atlas anatómicos o texto con IA.

Universidad de Alcalá.

arodrideantonio@gmail.com

XI Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2026.
XX Simposio de Dianas Terapéuticas.
16 a 18 de marzo, 2026. Universidad de Alcalá. Alcalá de Henares, Madrid. España.

Resumen

La inteligencia artificial ha experimentado un gran desarrollo en los últimos años permitiendo nuevas aplicaciones en la generación de imágenes en dos y tres dimensiones a partir de descripciones de texto e imágenes de referencia. Esta tecnología presenta valor para el desarrollo de modelos anatómicos enfocados en la enseñanza, simulación e impresión 3D. La reconstrucción tridimensional a partir de imágenes planas se basa en arquitecturas de redes neuronales convolucionales (CNN), modelos de estimación de profundidad monocular y modelos de difusión como Neural Radiance Fields (NeRF). Estos sistemas analizan la imagen 2D, identifican patrones anatómicos y generan una estimación volumétrica de la estructura representada, posteriormente se transforma en una maya tridimensional en formatos como STL y OBJ permitiendo su manipulación digital o impresión 3D. Este proceso permite convertir ilustraciones de atlas anatómicos en modelos tridimensionales que faciliten la comprensión espacial de estructuras complejas. Esta herramienta puede ser útil para generar material educativo personalizado o prototipos conceptuales.
A pesar de su potencial, presenta limitaciones y riesgos. La reconstrucción tridimensional desde una sola imagen genera interferencias que no están en la imagen original lo que pueden producir reconstrucciones plausibles pero incorrectas. La IA puede reproducir fielmente la apariencia general pero interpretar de forma errónea volúmenes, relaciones espaciales o continuidad entre estructuras. Los modelos generados únicamente a partir de prompts textuales pueden introducir errores anatómicos significativos como inserciones musculares incorrectas, trayectorias nerviosas inexactas o proporciones irreales entre órganos, debido a debido a que estos sistemas se basan en correlaciones estadísticas aprendidas durante el entrenamiento y no en un conocimiento fisiológico real. El problema más relevante surge cuando estos modelos generados con IA se comparten como modelos anatómicos reales y exactos lo genera una transmisión de conocimiento erróneo, especialmente si los usuarios no cuentan con formación suficiente para detectar inconsistencias anatómicas. La alta calidad que pueden alcanzar estos modelos genera un efecto de “realismo convincente”, en el que estructuras incorrectas parecen plausibles y pueden ser asumidas como correctas. Asimismo, existen cuestiones legales y éticas relacionadas con los derechos de autor de los atlas anatómicos utilizados como referencia y con la responsabilidad en caso de que un modelo generado por IA sea utilizado en contextos clínicos o formativos sin la debida supervisión.
En conclusión, aunque la inteligencia artificial aplicada a la generación de modelos anatómicos tridimensionales representa una herramienta prometedora para la educación, la investigación y el desarrollo de modelos tridimensionales imprimibles, su uso debe integrarse con criterios científicos rigurosos, validación anatómica por especialistas y una comprensión clara de sus limitaciones, evitando considerar estas representaciones como equivalentes a modelos anatómicos reales sin un proceso previo de verificación y control de calidad.

Cita: A. Bárcenas, Rodrigo; Grande Alonso, Rafael; Sebastián-Martín, Alba; Ramírez Carracedo, Monica; Fernández-Baillo Gallego de la Sacristana, Roberto; Aguado Henche, Salud Soledad; Hernández Fernández, Lorenzo Mauricio; Moreno-Gómez-Toledano, Rafael (2026) Generación de modelos anatómicos 3D a partir de imágenes 2D de atlas anatómicos o texto con IA. Actas del XI Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2026. XX Simposio de Dianas Terapéuticas. 16 a 18 de marzo, 2026. Universidad de Alcalá. Alcalá de Henares, Madrid. España. dianas 15 (1): e202603x028. ISSN 1886-8746 (electronic) journal.dianas.e202603x028 https://dianas.web.uah.es/journal/e202603x028. URI http://hdl.handle.net/10017/15181

Copyright: © A.-Bárcenas R, Grande-Alonso R, Sebastián-Martín A, Ramírez-Carracedo M, Fernández-Baillo-Gallego-de-la-Sacristana R, Aguado-Henche SS, Hernández-Fernández LM, Moreno-Gómez-Toledano R. Algunos derechos reservados. Este es un artículo open-access distribuido bajo los términos de una licencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-SinObraDerivada 4.0 Internacional. http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/

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dianas 15 (1) Ayuso-Cerezo etal 2026 Evaluación de la celularidad tumoral en carcinoma no microcítico de pulmón: estudio de concordancia entre patólogos, análisis digital e inteligencia artificial.

dianas 15(1) > Ayuso-Cerezo etal

dianas | Vol 15 Num 1 | marzo 2026 | e202603x017

Evaluación de la celularidad tumoral en carcinoma no microcítico de pulmón: estudio de concordancia entre patólogos, análisis digital e inteligencia artificial.

1. Facultad de Medicina y Ciencias de la Salud, Universidad de Alcalá, Madrid, España.  2. Servicio de Anatomía Patológica, Hospital Universitario Ramón y Cajal, IRYCIS, Madrid, España.  3. Centro de Investigación Biomédica en Red Cáncer (CIBERONC), Instituto de Salud Carlos III, Madrid, España.  4. Servicio de Oncología Médica, Hospital Universitario Ramón y Cajal, IRYCIS, Madrid, España.

ahugoayusocerezo@gmail.com

XI Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2026.
XX Simposio de Dianas Terapéuticas.
16 a 18 de marzo, 2026. Universidad de Alcalá. Alcalá de Henares, Madrid. España.

Resumen

La determinación del porcentaje de celularidad neoplásica de biopsias tumorales es estimado visualmente por un patólogo. Esta estimación es necesaria siempre que la muestra requiera de técnicas complementarias de biología molecular, situando el umbral de aceptación en 20% de celularidad tumoral. Este estudio tiene como objetivo principal determinar si los resultados de dos metodologías basadas en inteligencia artificial concuerdan con la estimación visual del patólogo. Para ello se seleccionaron retrospectivamente biopsias de pacientes diagnosticados de carcinoma no microcítico de pulmón (NSCLC) de la cohorte del proyecto INGENIO. Cada bloque tumoral fue teñido con hematoxilina-eosina y las preparaciones histológicas resultantes fueron escaneadas por un escáner UFS Philips. Por un lado, un patólogo experto en patología pulmonar estimó visualmente el porcentaje de celularidad tumoral. Por otro lado, para la estimación digital se emplearon dos metodologías basadas en inteligencia artificial. En la primera, QuPath, se realizó la anotación manual del área del tumor y de tejido sano, se realizó una segmentación celular con un algoritmo integrado en el software y se clasificaron las células en tumorales y estromales empleando una red neuronal artificial. En la segunda se empleó una plataforma comercial, AISight. En ella se introdujeron todas las biopsias y directamente obtuvimos el porcentaje neoplásico sin intervención manual previa. El análisis estadístico se realizó en R. Se consideraron significativos los p<0,05 en el coeficiente de correlación intraclase (ICC) y se analizaron los resultados mediante los gráficos de Bland-Altman, calculando el sesgo medio (bias) y los límites de acuerdo (bias ± 1,96SD). Tras analizar 125 biopsias de pacientes con NSCLC, AISight muestra una mayor concordancia con la estimación visual del patólogo (ICC = 0,83; p < 0,001) presentando un sesgo despreciable [bias = –0,96%; IC95%(–23,29; 21,38)]. Por el contrario, QuPath presenta una concordancia moderada con el patólogo (ICC = 0,69; p < 0,001) pero una tendencia sistemática a sobreestimar la celularidad tumoral [bias = –11,52%; IC95%(–42,98; 19,81)]. Al comparar las metodologías basadas en inteligencia artificial se muestra una concordancia moderada (ICC = 0,66; p < 0,001). En este caso, QuPath arroja valores significativamente superiores a AISight (bias = –10,57%), con una variabilidad elevada entre ambos métodos [IC95%(–41,90; 20,76)]. En conclusión, AISight demuestra ser una metodología más robusta y fiel al criterio del patólogo, mientras que la intervención humana en QuPath introduce un sesgo de sobreestimación que podría comprometer la precisión de la selección de muestras para estudios moleculares.

Cita: Ayuso-Cerezo, Hugo; Torres-Calcines, Natalia; Benito-Berlinches, Amparo; Aso-Manso, Sonsoles; Caniego-Casas, Tamara; García, Miguel; Pérez-Mies, Belén; Palacios, José; Carretero-Barrio, Irene (2026) Evaluación de la celularidad tumoral en carcinoma no microcítico de pulmón: estudio de concordancia entre patólogos, análisis digital e inteligencia artificial. Actas del XI Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2026. XX Simposio de Dianas Terapéuticas. 16 a 18 de marzo, 2026. Universidad de Alcalá. Alcalá de Henares, Madrid. España. dianas 15 (1): e202603x017. ISSN 1886-8746 (electronic) journal.dianas.e202603x017 https://dianas.web.uah.es/journal/e202603x017. URI http://hdl.handle.net/10017/15181

Copyright: © Ayuso-Cerezo H, Torres-Calcines N, Benito-Berlinches A, Aso-Manso S, Caniego-Casas T, García M, Pérez-Mies B, Palacios J, Carretero-Barrio I. Algunos derechos reservados. Este es un artículo open-access distribuido bajo los términos de una licencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-SinObraDerivada 4.0 Internacional. http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/

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dianas 15 (1) González-Sánchez etal 2026 Nueva herramienta automatizada para el análisis transcriptómico integrado (RNA-seq), orientada a la interpretación biológica.

dianas 15(1) > González-Sánchez etal

dianas | Vol 15 Num 1 | marzo 2026 | e202603x011

Nueva herramienta automatizada para el análisis transcriptómico integrado (RNA-seq), orientada a la interpretación biológica.

INARI BIOTECH.

aalejandro.go.san11@gmail.com; inaribiotech@gmail.com

XI Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2026.
XX Simposio de Dianas Terapéuticas.
16 a 18 de marzo, 2026. Universidad de Alcalá. Alcalá de Henares, Madrid. España.

Resumen

El análisis transcriptómico por RNA-seq es una herramienta clave para caracterizar los programas de expresión génica que sustentan los mecanismos moleculares implicados en enfermedad, así como para identificar biomarcadores con potencial diagnóstico, pronóstico o terapéutico. Aunque, existen diversos métodos y herramientas para el análisis del RNA-seq, estos métodos están dispersos, requieren experiencia técnica, generan salidas heterogéneas, y rara vez producen directamente resultados integrados, orientados a interpretación biológica. En este trabajo se presenta un procedimiento automatizado de análisis transcriptómico diseñado para transformar datos crudos RNA-seq humano en resultados directamente interpretables desde el punto de vista biológico. La aproximación integra el control de calidad de las lecturas, su alineamiento al genoma de referencia, el ensamblado, la cuantificación de la expresión génica, la identificación de genes diferencialmente expresados entre condiciones y varios niveles complementarios de interpretación funcional, incluyendo enriquecimiento en términos GO y rutas KEGG, análisis de enriquecimiento de conjuntos génicos y redes de interacción proteína-proteína. El procedimiento se evaluó sobre datos de RNA-seq de 10 líneas celulares de cáncer humano, lo que permitió identificar miles de genes con cambios significativos de expresión y revelar alteraciones coordinadas en procesos relacionados con desarrollo, organización tisular, matriz extracelular, regulación de la adhesión celular, así como en múltiples procesos y vías funcionales implicados en fenotipos tumorales. La integración de análisis basados en genes individuales y en conjuntos génicos facilita detectar tanto cambios puntuales como reprogramaciones funcionales globales. A diferencia de estudios centrados en análisis aislados, esta estrategia proporciona una solución integrada, reproducible y orientada a la interpretación mecanística, que acelera la transición desde datos transcriptómicos hasta hipótesis sobre mecanismos moleculares y candidatos a biomarcador. El procedimiento constituye así una plataforma versátil para estudios de señalización celular y para el descubrimiento sistemático de firmas transcriptómicas asociadas a estados biológicos y patológicos.

Cita: González Sánchez, Alejandro; Martínez Toledo, Cristina; Esteban Lasso, Alfonso (2026) Nueva herramienta automatizada para el análisis transcriptómico integrado (RNA-seq), orientada a la interpretación biológica. Actas del XI Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2026. XX Simposio de Dianas Terapéuticas. 16 a 18 de marzo, 2026. Universidad de Alcalá. Alcalá de Henares, Madrid. España. dianas 15 (1): e202603x011. ISSN 1886-8746 (electronic) journal.dianas.e202603x011 https://dianas.web.uah.es/journal/e202603x011. URI http://hdl.handle.net/10017/15181

Copyright: © González-Sánchez A, Martínez-Toledo C, Esteban-Lasso A. Algunos derechos reservados. Este es un artículo open-access distribuido bajo los términos de una licencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-SinObraDerivada 4.0 Internacional. http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/

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dianas 15 (1) García-Nafría etal 2026 Análisis computacional y experimental del C8-acil-glucósido de floretina en la línea de cáncer de próstata PC3.

dianas 15(1) > García-Nafría etal

dianas | Vol 15 Num 1 | marzo 2026 | e202603x007

Análisis computacional y experimental del C8-acil-glucósido de floretina en la línea de cáncer de próstata PC3.

Inari Biotech. Universidad de Alcalá.

aalejandro.garcianafr@edu.uah.es; alejandrogarcianafria@gmail.com  blucia.reals@edu.uah.es; luciareal2004@gmail.com  celena.vuelta@uah.es  dcristinacoscolin@gmail.com

XI Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2026.
XX Simposio de Dianas Terapéuticas.
16 a 18 de marzo, 2026. Universidad de Alcalá. Alcalá de Henares, Madrid. España.

Resumen

La acetiltransferasa de histonas HAT1 desempeña un papel relevante en la regulación epigenética asociada a procesos de proliferación, supervivencia y adaptación celular, y ha sido identificada como una diana terapéutica emergente en distintos tipos de cáncer. JG2016 es un compuesto sintético caracterizado como inhibidor específico de HAT1 y se emplea como compuesto de referencia en este estudio. De forma paralela, las floretinas ha mostrado actividad biológica en diferentes modelos tumorales, despertando interés por su potencial impacto sobre rutas celulares clave. En el presente trabajo se investiga el C8-acil-glucósido de floretina, previamente caracterizado como inhibidor de la hexoquinasa, con el objetivo de explorar su posible interacción con HAT1 y su efecto sobre la viabilidad celular en la línea de cáncer de próstata PC3. Para ello, se aplicó una aproximación integradora basada en herramientas de modelado molecular y ensayos celulares. El docking molecular del inhibidor JG2016 con HAT1, previamente validado a nivel experimental, se utilizó como referencia para analizar in silico la capacidad de interacción del C8-acil-glucósido de floretina en el mismo entorno de unión. Posteriormente, se evaluó el efecto funcional del compuesto mediante ensayos de viabilidad celular (XTT) y análisis morfológico en células PC3 tratadas con JG2016 y con el derivado de floretina. Los resultados obtenidos indican que el C8-acil-glucósido de floretina provoca una disminución significativa de la viabilidad celular, acompañada de alteraciones morfológicas compatibles con un efecto antiproliferativo, en concordancia con las predicciones derivadas del estudio computacional. En conjunto, este trabajo refuerza la utilidad de enfoques combinados in silico–in vitro para la evaluación de compuestos bioactivos y sugiere que derivados de floretina con actividad metabólica conocida podrían explorarse como candidatos para el reposicionamiento hacia dianas epigenéticas relevantes en cáncer sólido.

Cita: García-Nafría, Alejandro; Real, Lucía; Fernández-Crippa, Leire; Vuelta, Elena; Garcia-Tuñon, Ignacio; Gonzalez-Alfonso, José L.; Plou, Francisco J.; Ortega, Miguel A.; Martinez-Toledo, Cristina; Coscolín, Cristina (2026) Análisis computacional y experimental del C8-acil-glucósido de floretina en la línea de cáncer de próstata PC3. Actas del XI Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2026. XX Simposio de Dianas Terapéuticas. 16 a 18 de marzo, 2026. Universidad de Alcalá. Alcalá de Henares, Madrid. España. dianas 15 (1): e202603x007. ISSN 1886-8746 (electronic) journal.dianas.e202603x007 https://dianas.web.uah.es/journal/e202603x007. URI http://hdl.handle.net/10017/15181

Copyright: © García-Nafría A, Real L, Fernández-Crippa L, Vuelta E, Garcia-Tuñon I, Gonzalez-Alfonso JL, Plou FJ, Ortega MA, Martinez-Toledo C, Coscolín C. Algunos derechos reservados. Este es un artículo open-access distribuido bajo los términos de una licencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-SinObraDerivada 4.0 Internacional. http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/

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dianas 15 (1) Real etal 2026 Potencial del 8-acil-glucósido de floretina como posible modulador de HAT1 en células K562.

dianas 15(1) > Real etal

dianas | Vol 15 Num 1 | marzo 2026 | e202603x006

Potencial del 8-acil-glucósido de floretina como posible modulador de HAT1 en células K562.

Inari Biotech. Universidad de Alcalá.

alucia.reals@edu.uah.es; luciareal2004@gmail.com  balejandro.garcianafr@edu.uah.es; alejandrogarcianafria@gmail.com  celena.vuelta@uah.es  dcristinacoscolin@gmail.com

XI Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2026.
XX Simposio de Dianas Terapéuticas.
16 a 18 de marzo, 2026. Universidad de Alcalá. Alcalá de Henares, Madrid. España.

Resumen

La acetiltransferasa de histonas HAT1 participa en la regulación epigenética asociada a proliferación y supervivencia celular, y ha sido propuesta como una diana terapéutica emergente en cáncer. Su inhibidor, JG2016, ha sido caracterizado experimentalmente como modulador de HAT1 y se utiliza como molécula de referencia. Por otra parte, las floretinas ha n mostrado actividad biológica en células tumorales. En trabajos previos, se ha descrito la inhibición de la hexoquinasa por un derivado de floretina, lo que sugiere un posible impacto sobre rutas metabólicas clave, implicadas en la proliferación celular. En este trabajo se evalúa el potencial del C8-acil-glucósido de floretina, previamente estudiado como inhibidor de hexoquinasa, como candidato para modular HAT1 y su impacto sobre la viabilidad celular en la línea leucémica K562 , derivada de leucemia mieloide crónica en fase blástica. Se empleó una estrategia integradora que combina modelado computacional mediante docking molecular y validación experimental en cultivo celular. El docking de HAT1 con el inhibidor JG2016, previamente validado en cultivo celular, se utilizó como referencia para evaluar in silico el potencial de interacción del C8-acil-glucósido de floretina en el mismo sitio de unión. La validación experimental de los efectos sobre viabilidad celular se llevó a cabo mediante ensayos con XTT y análisis morfológico en células K562 tratadas con JG2016 y con el derivado de floretina. Los resultados muestran que el C8-acil-glucósido de floretina induce una reducción significativa de la viabilidad celular, en concordancia con las predicciones del estudio computacional. En conjunto, este trabajo pone de manifiesto la utilidad de enfoques integrados computacional–experimentales para la exploración de nuevas interacciones fármaco-diana en señalización celular y el reposicionamiento de compuestos bioactivos hacia dianas epigenéticas.

Cita: Real, Lucía; García-Nafría, Alejandro; Fernández-Crippa, Leire; Vuelta, Elena; Garcia-Tuñon, Ignacio; Gonzalez-Alfonso, José L.; Plou, Francisco J.; Ortega, Miguel A.; Martinez-Toledo, Cristina; Coscolín, Cristina (2026) Potencial del 8-acil-glucósido de floretina como posible modulador de HAT1 en células K562. Actas del XI Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2026. XX Simposio de Dianas Terapéuticas. 16 a 18 de marzo, 2026. Universidad de Alcalá. Alcalá de Henares, Madrid. España. dianas 15 (1): e202603x006. ISSN 1886-8746 (electronic) journal.dianas.e202603x006 https://dianas.web.uah.es/journal/e202603x006. URI http://hdl.handle.net/10017/15181

Copyright: © Real L, García-Nafría A, Fernández-Crippa L, Vuelta E, Garcia-Tuñon I, Gonzalez-Alfonso JL, Plou FJ, Ortega MA, Martinez-Toledo C, Coscolín C. Algunos derechos reservados. Este es un artículo open-access distribuido bajo los términos de una licencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-SinObraDerivada 4.0 Internacional. http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/

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