dianas 15(1) > González-Sánchez etal

dianas | Vol 15 Num 1 | marzo 2026 | e202603x011

Nueva herramienta automatizada para el análisis transcriptómico integrado (RNA-seq), orientada a la interpretación biológica.

Alejandro González Sánchez, Cristina Martínez Toledo, Alfonso Esteban Lasso

INARI BIOTECH.

a. alejandro.go.san11@gmail.com; inaribiotech@gmail.com

XI Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2026.
XX Simposio de Dianas Terapéuticas.
16 a 18 de marzo, 2026. Universidad de Alcalá. Alcalá de Henares, Madrid. España.

Palabras clave: RNA-seq; análisis transcriptómico; pipeline automatizado; análisis integrado; biomarcadores; expresión génica diferencial

Resumen

El análisis transcriptómico por RNA-seq es una herramienta clave para caracterizar los programas de expresión génica que sustentan los mecanismos moleculares implicados en enfermedad, así como para identificar biomarcadores con potencial diagnóstico, pronóstico o terapéutico. Aunque, existen diversos métodos y herramientas para el análisis del RNA-seq, estos métodos están dispersos, requieren experiencia técnica, generan salidas heterogéneas, y rara vez producen directamente resultados integrados, orientados a interpretación biológica. En este trabajo se presenta un procedimiento automatizado de análisis transcriptómico diseñado para transformar datos crudos RNA-seq humano en resultados directamente interpretables desde el punto de vista biológico. La aproximación integra el control de calidad de las lecturas, su alineamiento al genoma de referencia, el ensamblado, la cuantificación de la expresión génica, la identificación de genes diferencialmente expresados entre condiciones y varios niveles complementarios de interpretación funcional, incluyendo enriquecimiento en términos GO y rutas KEGG, análisis de enriquecimiento de conjuntos génicos y redes de interacción proteína-proteína. El procedimiento se evaluó sobre datos de RNA-seq de 10 líneas celulares de cáncer humano, lo que permitió identificar miles de genes con cambios significativos de expresión y revelar alteraciones coordinadas en procesos relacionados con desarrollo, organización tisular, matriz extracelular, regulación de la adhesión celular, así como en múltiples procesos y vías funcionales implicados en fenotipos tumorales. La integración de análisis basados en genes individuales y en conjuntos génicos facilita detectar tanto cambios puntuales como reprogramaciones funcionales globales. A diferencia de estudios centrados en análisis aislados, esta estrategia proporciona una solución integrada, reproducible y orientada a la interpretación mecanística, que acelera la transición desde datos transcriptómicos hasta hipótesis sobre mecanismos moleculares y candidatos a biomarcador. El procedimiento constituye así una plataforma versátil para estudios de señalización celular y para el descubrimiento sistemático de firmas transcriptómicas asociadas a estados biológicos y patológicos.

dianas 15(1) > García-Nafría etal

dianas | Vol 15 Num 1 | marzo 2026 | e202603x007

Análisis computacional y experimental del C8-acil-glucósido de floretina en la línea de cáncer de próstata PC3.

Alejandro García-Nafría, Lucía Real, Leire Fernández-Crippa, Elena Vuelta, Ignacio Garcia-Tuñon, José L. Gonzalez-Alfonso, Francisco J. Plou, Miguel A. Ortega, Cristina Martinez-Toledo, Cristina Coscolín

Inari Biotech. Universidad de Alcalá.

a. alejandro.garcianafr@edu.uah.es; alejandrogarcianafria@gmail.com  b. lucia.reals@edu.uah.es; luciareal2004@gmail.com  c. elena.vuelta@uah.es  d. cristinacoscolin@gmail.com

XI Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2026.
XX Simposio de Dianas Terapéuticas.
16 a 18 de marzo, 2026. Universidad de Alcalá. Alcalá de Henares, Madrid. España.

Palabras clave: HAT1; floretina; docking molecular; cáncer de próstata; PC3; viabilidad celular (XTT)

Resumen

La acetiltransferasa de histonas HAT1 desempeña un papel relevante en la regulación epigenética asociada a procesos de proliferación, supervivencia y adaptación celular, y ha sido identificada como una diana terapéutica emergente en distintos tipos de cáncer. JG2016 es un compuesto sintético caracterizado como inhibidor específico de HAT1 y se emplea como compuesto de referencia en este estudio. De forma paralela, las floretinas ha mostrado actividad biológica en diferentes modelos tumorales, despertando interés por su potencial impacto sobre rutas celulares clave. En el presente trabajo se investiga el C8-acil-glucósido de floretina, previamente caracterizado como inhibidor de la hexoquinasa, con el objetivo de explorar su posible interacción con HAT1 y su efecto sobre la viabilidad celular en la línea de cáncer de próstata PC3. Para ello, se aplicó una aproximación integradora basada en herramientas de modelado molecular y ensayos celulares. El docking molecular del inhibidor JG2016 con HAT1, previamente validado a nivel experimental, se utilizó como referencia para analizar in silico la capacidad de interacción del C8-acil-glucósido de floretina en el mismo entorno de unión. Posteriormente, se evaluó el efecto funcional del compuesto mediante ensayos de viabilidad celular (XTT) y análisis morfológico en células PC3 tratadas con JG2016 y con el derivado de floretina. Los resultados obtenidos indican que el C8-acil-glucósido de floretina provoca una disminución significativa de la viabilidad celular, acompañada de alteraciones morfológicas compatibles con un efecto antiproliferativo, en concordancia con las predicciones derivadas del estudio computacional. En conjunto, este trabajo refuerza la utilidad de enfoques combinados in silico–in vitro para la evaluación de compuestos bioactivos y sugiere que derivados de floretina con actividad metabólica conocida podrían explorarse como candidatos para el reposicionamiento hacia dianas epigenéticas relevantes en cáncer sólido.

dianas 15(1) > Real etal

dianas | Vol 15 Num 1 | marzo 2026 | e202603x006

Potencial del 8-acil-glucósido de floretina como posible modulador de HAT1 en células K562.

Lucía Real, Alejandro García-Nafría, Leire Fernández-Crippa, Elena Vuelta, Ignacio Garcia-Tuñon, José L. Gonzalez-Alfonso, Francisco J. Plou, Miguel A. Ortega, Cristina Martinez-Toledo, Cristina Coscolín

Inari Biotech. Universidad de Alcalá.

a. lucia.reals@edu.uah.es; luciareal2004@gmail.com  b. alejandro.garcianafr@edu.uah.es; alejandrogarcianafria@gmail.com  c. elena.vuelta@uah.es  d. cristinacoscolin@gmail.com

XI Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2026.
XX Simposio de Dianas Terapéuticas.
16 a 18 de marzo, 2026. Universidad de Alcalá. Alcalá de Henares, Madrid. España.

Palabras clave: HAT1; floretina; C8-acil-glucósido; K562; docking molecular; XTT; epigenética

Resumen

La acetiltransferasa de histonas HAT1 participa en la regulación epigenética asociada a proliferación y supervivencia celular, y ha sido propuesta como una diana terapéutica emergente en cáncer. Su inhibidor, JG2016, ha sido caracterizado experimentalmente como modulador de HAT1 y se utiliza como molécula de referencia. Por otra parte, las floretinas ha n mostrado actividad biológica en células tumorales. En trabajos previos, se ha descrito la inhibición de la hexoquinasa por un derivado de floretina, lo que sugiere un posible impacto sobre rutas metabólicas clave, implicadas en la proliferación celular. En este trabajo se evalúa el potencial del C8-acil-glucósido de floretina, previamente estudiado como inhibidor de hexoquinasa, como candidato para modular HAT1 y su impacto sobre la viabilidad celular en la línea leucémica K562 , derivada de leucemia mieloide crónica en fase blástica. Se empleó una estrategia integradora que combina modelado computacional mediante docking molecular y validación experimental en cultivo celular. El docking de HAT1 con el inhibidor JG2016, previamente validado en cultivo celular, se utilizó como referencia para evaluar in silico el potencial de interacción del C8-acil-glucósido de floretina en el mismo sitio de unión. La validación experimental de los efectos sobre viabilidad celular se llevó a cabo mediante ensayos con XTT y análisis morfológico en células K562 tratadas con JG2016 y con el derivado de floretina. Los resultados muestran que el C8-acil-glucósido de floretina induce una reducción significativa de la viabilidad celular, en concordancia con las predicciones del estudio computacional. En conjunto, este trabajo pone de manifiesto la utilidad de enfoques integrados computacional–experimentales para la exploración de nuevas interacciones fármaco-diana en señalización celular y el reposicionamiento de compuestos bioactivos hacia dianas epigenéticas.